Нейрохирургическое отделение № 4 было образовано еще в далеком 1958г. с коечным фондом на 60 коек на базе городской клинической больницы № 2 г. Алма-Аты и на сегодняшний день является старейшим нейрохирургическим отделением в Республике Казахстан.
Отделение было развернуто как общее нейрохирургическое, в котором оказывалась помощь больным с опухолями ЦНС, с поражениями и заболеваниями позвоночника и спинного мозга, а также детям с опухолями и пороками развития ЦНС.
После переезда в ГКБ№ 7 в 1991г. от НХО№ 4 отделились и сформировались два самостоятельных отделения — спинальное и детское.
С 2007 года в отделении вновь стали лечить детей с онкологическими и врожденными проблемами ЦНС. Это отделение является одним из центров разработки новых методов и подходов в лечении нейроонкологических больных в Казахстане. Как и другие 3 нейрохирургических отделения стационара НХО № 4 с момента своего создания является клинической базой кафедры нейрохирургии Алматинского Государственного института усовершенствования врачей.
На протяжении последних 30 лет отделением заведовал один из основоположников Казахстанской нейрохирургии Заслуженный врач Республики Казахстан, нейрохирург высшей квалификационной категории, обладатель «Золотого скальпеля» республики Мейман Кожекович Кожеков.
В разные годы в отделении работали такие выдающиеся нейрохирурги как М. Г. Искаков, Л. А. Гофман, Ю. М. Дрогунов. Наиболее сложные операции на протяжении многих лет проводили доценты Е. А. Азарова и В.Е. Ейгинсон, профессор С. К. Акшулаков.